Παρά την απουσία πυκνών επαφών, οι πολιτικές σχέσεις μεταξύ Ελλάδας και Μογγολίας βρίσκονται σε πολύ καλό επίπεδο. Η Ελλάδα εκπροσωπείται στο Ουλάν Μπατόρ από την Πρεσβεία Πεκίνου, ενώ ο εκάστοτε Μογγόλος Πρέσβυς στην Σόφια είναι παράλληλα διαπιστευμένος και στην Ελλάδα.

Από τον Ιούνιο του 2011 λειτουργεί μόνιμος μηχανισμός πολιτικών διαβουλεύσεων μεταξύ των Υπουργείων Εξωτερικών των δύο χωρών, ενώ το ίδιο έτος συστήθηκε στο ελληνικό κοινοβούλιο ελληνομογγολική Ομάδα Φιλίας.

Σημειώνεται ότι, από τον Μάρτιο του 2013, οπότε ΕΕ και Μογγολία υπέγραψαν Συμφωνία Εταιρικής Σχέσης Συνεργασίας, δημιουργήθηκε κατάλληλο πλαίσιο για την περαιτέρω ανάπτυξη των σχέσεων της Ελλάδας με την εν λόγω χώρα, ιδίως στον οικονομικό και εμπορικό τομέα.