Η Ελλάδα εκπροσωπείται διπλωματικώς στο Σάο Τομέ και Πρίνσιπε, μέσω παράλληλης διαπίστευσης, από την ελληνική Πρεσβεία στην Λισσαβώνα.
Πολιτικές Σχέσεις
Οι σχέσεις των δύο χωρών είναι καλές και η συνεργασία τους τόσο σε διμερές όσο και σε πολυμερές επίπεδο είναι ικανοποιητική.
Η Ελλάδα παρέχει υποτροφίες μέσω της Υπηρεσίας Αναπτυξιακής βοήθειας. Στο πλαίσιο της Ε.Ε., προβλέπεται πολιτικός διάλογος με το Σάο Τομέ και Πρίνσιπε, καθώς και αναπτυξιακή βοήθεια από την Κοινότητα για την δημιουργία υποδομών και την στήριξη του πρϋπολογισμού.
Αρμόδια η Πρεσβεία της Ελλάδας στη Λισσαβώνα, Πορτογαλία.